MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021081	GGTA	2	8	1490523	1490530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021081	TAG	2	6	1494302	1494307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021081	CA	3	6	1494329	1494334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_021081	A	6	6	1494397	1494402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021081	TTA	2	6	1494405	1494410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021081	CAA	2	6	1494417	1494422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_021081	CGC	2	6	1494439	1494444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_021081	AGG	2	6	1494473	1494478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021081	GATG	2	8	1494531	1494538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021081	GC	4	8	1494541	1494548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_021081	GTT	2	6	1494612	1494617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021081	GCTC	2	8	1494629	1494636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_021081	TGC	2	6	1494666	1494671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_021081	AGG	2	6	1494689	1494694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021081	GC	3	6	1499301	1499306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_021081	CAG	2	6	1501248	1501253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021081	AGC	2	6	1501306	1501311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_021081	GCCACA	2	12	1501414	1501425	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_021081	CGT	2	6	1501536	1501541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_021081	GA	3	6	1501906	1501911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021081	GA	3	6	1502091	1502096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021081	CGG	2	6	1502141	1502146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_021081	GCC	2	6	1502158	1502163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_021081	GCC	2	6	1502223	1502228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_021081	GCA	2	6	1502272	1502277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_021081	TCG	2	6	1502289	1502294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_021081	CCG	2	6	1503487	1503492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_021081	GCTT	2	8	1503508	1503515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_021081	T	6	6	1503561	1503566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021081	GAT	2	6	1503697	1503702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021081	GGC	2	6	1503738	1503743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_021081	GTA	2	6	1503764	1503769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021081	GC	3	6	1503936	1503941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_021081	ATGTA	2	10	1503946	1503955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021081	TGG	2	6	1504002	1504007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021081	CGT	2	6	1504009	1504014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021081	GCC	2	6	1504173	1504178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_021081	TGC	2	6	1504234	1504239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021081	CGC	2	6	1504243	1504248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_021081	CCA	2	6	1504430	1504435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_021081	GCCC	2	8	1504600	1504607	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3042	NC_021081	ACC	2	6	1504859	1504864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_021081	ACA	2	6	1504969	1504974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021081	AAG	2	6	1505021	1505026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021081	CGG	2	6	1505077	1505082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_021081	GCG	2	6	1505090	1505095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_021081	TGG	2	6	1505157	1505162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021081	ACCG	2	8	1505319	1505326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_021081	GAC	2	6	1505528	1505533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021081	ACT	2	6	1505577	1505582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_021081	TTG	2	6	1505700	1505705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021081	TCG	2	6	1505897	1505902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_021081	GCT	2	6	1506034	1506039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_021081	TGG	2	6	1506085	1506090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021081	GGCT	2	8	1506108	1506115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_021081	AGG	2	6	1506165	1506170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021081	AAGG	2	8	1509324	1509331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021081	GGGC	2	8	1509386	1509393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_021081	GGCCT	2	10	1509419	1509428	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3060	NC_021081	AGG	2	6	1509465	1509470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021081	CGGGG	2	10	1512605	1512614	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_021081	G	6	6	1512611	1512616	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021081	GCG	2	6	1513647	1513652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_021081	GGA	2	6	1513683	1513688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021081	GCA	2	6	1517382	1517387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_021081	CTGGC	2	10	1519640	1519649	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3067	NC_021081	TGG	2	6	1519654	1519659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021081	GTA	2	6	1519665	1519670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021081	AGGG	2	8	1519675	1519682	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021081	GGA	2	6	1520578	1520583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021081	CCCG	2	8	1521574	1521581	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3072	NC_021081	CTC	2	6	1521595	1521600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_021081	A	7	7	1523624	1523630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021081	CGC	2	6	1523633	1523638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_021081	GCT	2	6	1525530	1525535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_021081	GGTG	2	8	1525597	1525604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021081	TGA	2	6	1525605	1525610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021081	GCT	2	6	1525617	1525622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_021081	GCT	2	6	1525684	1525689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_021081	GAGG	2	8	1525710	1525717	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021081	GGC	2	6	1525730	1525735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_021081	GCT	2	6	1525767	1525772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_021081	CTC	2	6	1525824	1525829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_021081	CCT	2	6	1525844	1525849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_021081	TAA	2	6	1525862	1525867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021081	ATG	2	6	1525939	1525944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021081	CATC	2	8	1526099	1526106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_021081	GAG	2	6	1526126	1526131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021081	GAA	3	9	1526139	1526147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021081	TAG	2	6	1526150	1526155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021081	CCCG	2	8	1528956	1528963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3092	NC_021081	GTA	2	6	1529691	1529696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021081	CCT	2	6	1534105	1534110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_021081	CTT	2	6	1534218	1534223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_021081	GGCCC	2	10	1534236	1534245	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3096	NC_021081	GGT	2	6	1534353	1534358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021081	T	6	6	1535205	1535210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021081	CAAG	2	8	1535227	1535234	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_021081	AGG	2	6	1535249	1535254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021081	TCG	2	6	1535274	1535279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021081	GCT	2	6	1535292	1535297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_021081	CGGTG	2	10	1535307	1535316	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3103	NC_021081	CCA	2	6	1535336	1535341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_021081	GAG	2	6	1536252	1536257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021081	AGA	2	6	1538849	1538854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021081	G	6	6	1541175	1541180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021081	AGGCC	2	10	1541206	1541215	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3108	NC_021081	TCGT	2	8	1541259	1541266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_021081	GAG	2	6	1543718	1543723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021081	GAT	2	6	1543731	1543736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021081	CTG	3	9	1543771	1543779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_021081	AGG	2	6	1543793	1543798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021081	GCT	2	6	1543815	1543820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_021081	CAC	2	6	1543833	1543838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_021081	CTG	2	6	1543926	1543931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_021081	CGG	2	6	1544483	1544488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021081	ACC	2	6	1544508	1544513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_021081	CAT	2	6	1544630	1544635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_021081	GCA	2	6	1544664	1544669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_021081	CAAA	2	8	1544695	1544702	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_021081	GC	4	8	1544739	1544746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_021081	ACC	2	6	1544811	1544816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_021081	TCG	2	6	1544843	1544848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_021081	TCAA	2	8	1544857	1544864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_021081	CTC	2	6	1544880	1544885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_021081	TGCT	2	8	1544901	1544908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_021081	TTC	2	6	1544911	1544916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_021081	CTG	2	6	1544933	1544938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_021081	CCCG	2	8	1544952	1544959	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3130	NC_021081	GCGG	2	8	1544961	1544968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3132	NC_021081	ACC	2	6	1545004	1545009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3153	NC_021081	TGGG	2	8	1557717	1557724	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3255	NC_021081	CCGA	2	8	1604547	1604554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_021081	GTA	2	6	1604576	1604581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_021081	GCACA	2	10	1604648	1604657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3258	NC_021081	TCC	2	6	1606031	1606036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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